O IPAE dedica um grande espaço para o desenvolvimento musical dos seus alunos. São diversos grupos instrumentais e vocais como corais, banda e orquestra sinfônica.

O Conservatório Musical oferece cursos em mais de 15 áreas: piano, canto, flauta, clarineta, sax, trompete, trombone, violino, viola, cello, violão, baixo, guitarra, bateria, musicalização infantil e outros.

Além de proporcionar o aprendizado de diversos instrumentos, os cursos são sempre acompanhados por aulas de musicalidade ou percepção musical.